لوله سیلیکونی درجه مواد غذایی به طور کلی تماس مستقیم با مواد ضد عفونی کننده توصیه نمی شود. اگرچه لوله های سیلیکونی در برخی موارد می توانند مواد شیمیایی خاصی را تحمل کنند، مواد ضدعفونی کننده اغلب حاوی اکسیدان های قوی، کلریدها، الکل ها یا سایر اجزای شیمیایی خورنده و واکنش پذیر هستند که ممکن است با ژل سیلیکون واکنش داده و باعث خوردگی سطح، سخت شدن، تغییر رنگ یا تخریب عملکرد لوله سیلیکونی شوند.
برای مثال، اگرچه واکنش بین هیدروکسید سدیم و ژل سیلیکون در دمای اتاق نسبتاً ملایم است، اما ممکن است در دماهای بالا واکنش شدیدی داشته باشد و بر عملکرد لولههای سیلیکونی تأثیر بگذارد. به طور مشابه، مواد ضدعفونی کننده حاوی کلر مانند هیپوکلریت سدیم دارای خواص اکسید کننده قوی هستند و ممکن است به ساختار شیمیایی سیلیکاژل آسیب برساند. اگرچه ضدعفونی کننده های الکلی کمتر تحریک کننده هستند، اما قرار گرفتن در معرض طولانی مدت ممکن است اثرات نامطلوبی بر روی ژل سیلیکون داشته باشد.
